輸卵管妊娠的病因至今還是不能明確的，但主要可能原因可能是因為輸卵管異常。患者如果曾經患有慢性輸卵管炎、闌尾炎、盆腔結核、腹膜炎及子宮內膜異位癥都有可能會導致輸卵管粘連、狹窄、部分阻塞，導致輸卵管妊娠情況的出現。另外，輸卵管發育不良的話也會影響到受精卵的正常