小兒支原體肺炎的治療與一般肺炎的治療原則基本相同，采取綜合治療措施。包括一般治療、對癥治療、抗生素的應用、腎上腺皮質激素，以及肺外並發癥的治療等5個方面。治療最主要的是呼吸道隔離。由於支原體感染可造成小流行，且患兒病後排支原體的時間較長，可達1～2個月之外。