但值得註意的是臭腐乳發酵後，容易被微生物污染，豆腐坯中的蛋白質氧化分解後產生含硫的化合物。如果吃太多的臭腐乳，將對人體產生不良作用，影響身體健康。 另外，腐乳含鹽量普遍較高，高血壓、心血管病、腎病患者，宜少吃或不吃，以免加重病情。