百日咳桿菌侵入呼吸道後，附著在呼吸道上皮細胞的纖毛上繁殖並產生內毒素，引起纖毛運動障礙和纖毛細胞的破壞。支氣管粘膜廣泛炎癥，粘液分泌物增多，纖毛損傷：積聚的分泌物不斷地刺激呼吸道神經末梢，刺激傳入至大腦皮層，反射地引起痙攣性咳嗽在大腦皮層咳嗽中樞形成瞭興