由於醫用蘇打粉的純度和濃度都比較高，所以不建議吃醫用蘇打粉。醫用蘇打粉雖然同樣具有中和胃酸的作用，但是由於堿性太強，很容易導致體內二氧化碳過多，進而引發胃穿孔的問題。利用醫用蘇打粉制作的面點，也會導致成品帶有嚴重的堿味，從而影響到成品的口感和香氣。