再障的發病可能和下列因素有關：
1、藥物：是最常見的發病因素。
2、化學毒物：苯及其衍化物和再障關系已為許多實驗研究所肯定，苯進入人體易固定於富含脂肪的組織，慢性苯中毒時苯主要固定於骨髓，苯的骨髓毒性作用是其代謝產物所致，後者可作用於造血祖細胞，抑制其DNA和RNA的合成，並能損害染色體。
3、電離輻射：X線、γ線或中子可穿過或進入細胞直接損害造血幹細胞和骨髓微環境。長期超允許量放射線照射（如放射源事故）可致再障。
4、病毒感染：病毒性肝炎和再障的關系已較肯定，稱為病毒性肝炎相關性再障，是病毒性肝炎最嚴重的並發癥之一。引起再障的肝炎類型至今尚未肯定，可能為丙型肝炎，其餘由乙型肝炎引起。
5、免疫因素：再障可繼發於胸腺瘤、系統性紅斑狼瘡和類風濕性關節炎等，患者血清中可找到抑制造血幹細胞的抗體。部分原因不明的再障可能也存在免疫因素。
6、遺傳因素：貧血系常染色體隱性遺傳性疾病，有傢族性。
7、陣發性睡眠性血紅蛋白尿（PNH）：PNH和再障關系相當密切，兩者都是造血幹細胞的疾病。明確地從再障轉為PNH，而再障表現已不明顯；或明確地從PNH轉為再障，而PNH表現已不明顯；或PNH伴再障及再障伴PNH紅細胞，都可稱謂再障-PNH綜合征。
8、其他因素：罕有病例報告，再障在妊娠期發病，分娩或人工流產後緩解，第二次妊娠時再發，但多數認為可能是巧合。此外，再障尚可繼發於慢性腎功能衰竭、嚴重的甲狀腺或前（腺）腦垂體功能減退癥等。
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